أدى منذ وقت قصير الفريق محمد زكى، قائد قوات الحرس الجمهورى، حلف الأيمن، في مركز وظيفي وزير الحراسة، ليكون وزير الحراسة رقم 25 في سلسلة وزراء دفاع جمهورية مصر العربية منذ ثورة تموز 1952، وشغل الفريق محمد زكى مركز وظيفي قائد وحدات المظلات، وانتدب للعمل كقائد لوحدات الحرس الجمهورى في عصر الرئيس المنفصل محمد مرسى، وتولى منصبه كقائد لقوات الحرس الجمهورى في 8 شهر أغسطس 2012، وقد كان له دوره البارز في 30 شهر يونيو من العام 2013، حيث تولى حراسة مختلَف القصور الرئاسية.
وانحاز الفريق محمد زكى إلى متطلبات الشعب المصري في فعاليات الاتحادية، ورفض طلبا من محمد مرسى بفض اعتصام الاتحادية بالشدة، وصرح حينها على حسب مقال شهادته في المحكمة إن قوات الحرس الجمهورى لن تعتدى على أولاد الشعب ولا نتوقع أن يعتدى المصريون على الحرس الجمهورى.
وتحدث الفريق محمد زكى في شهادته: “باتجاه الساعة الثانية صباح يوم 5 شهر ديسمبر، ورده اتصال هاتفي من محمد مرسى رئيس الدولة زمانها يأمره بفض الاعتصام أثناء ساعة واحدة بالشدة شخص عليه باستحالة تطبيق هذا الشأن حتى لا تقع خسائر ورفض تطبيق الشأن، وبعد مضى بعض الوقت سعى التواصل بمحمد مرسى فلم يقدر على، فاتصل بالمتهم أسعد الشيخة نائب رئيس ديوان رئيس الدولة زمانها وطلب منه وقت إضافي 24 ساعة لفض الاعتصام، دون استعمال القساوة، فأخبره الأخير بأنه اتصل بمحمد مرسى الذي نشر أوامره بعدم وجود أى من المعتصمين بمحيط القصر نحو حضوره صباحا.
يقال أن المهندس شريف إسماعيل، كان قد تقدم للرئيس عبدالفتاح السيسي باستقالة السلطات، وقام الرئيس بتكليف المهندس مصطفي مدبولي بتشكيل السلطات الحديثة، والفريق محمد زكي عمل كـ قائد وحدات المظلات، انتدب للعمل كقائد لوحدات الحرس الجمهورى في عصر الرئيس المنفصل محمد مرسي، وتولي منصبه كقائد لقوات الحرس الجمهوري في 8 آب 2012، وقد كان له دوره البارز في 30 حزيران من العام 2013 حيث تولى حراسة مختلَف القصور الرئاسية، كان شاهدا رئيسيا بحكم منصبه في قضية التخابر المدعى عليه بها الرئيس المنفصل وآخرون، تم ترقيته في كانون الثاني 2017 لرتبة فريق.
كان الفريق محمد زكى، شاهدا رئيسيا بحكم منصبه في قضية التخابر المدعى عليه بها الرئيس المنفصل وآخرون.
